Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EdaO54693 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
EdaO54693 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
EdaO54693 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms