Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms