Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm20828J3KMI7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm20828J3KMI7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms