Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r34G3XA52 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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