Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms