Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms