Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms