Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tuba8Q9JJZ2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms