Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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