Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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