Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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