Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc6a20aQ8VDB9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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