Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Bhlhb9Q6PB60 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms