Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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