Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim58Q5NCC9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms