Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnpc3Q3UZ01 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnpc3Q3UZ01 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnpc3Q3UZ01 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms