Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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