Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms