Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms