Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms