Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
LtbP41155 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtbP41155 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms