Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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P18525 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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P18525 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18525 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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