Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms