Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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