Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms