Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PplQ9R269 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms