Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpc6Q9R087 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms