Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms