Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ChmQ9QXG2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms