Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms