Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NubplQ9CWD8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms