Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd4Q9CQ02 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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