Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtn4Q99P72 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtn4Q99P72 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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