Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp20Q8C6M1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp20Q8C6M1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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