Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms