Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shq1Q7TMX5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms