Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Atg16l2Q6KAU8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms