Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms