Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gjb4Q02738 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms