Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grin2bQ01097 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms