Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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