Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rab11bP46638 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms