Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ThpoP40226 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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