Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrbP28704 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RxrbP28704 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RxrbP28704 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RxrbP28704 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RxrbP28704 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RxrbP28704 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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