Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P01649 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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P01649 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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P01649 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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P01649 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01649 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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