Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tmed2Q9R0Q3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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