Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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AmfrQ9R049 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmfrQ9R049 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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