Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms