Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a2Q9D8F3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms