Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms